天冬氨酸酶的催化机制
Mg²⁺ 配位 · 丝氨酸夺质子 · 碳负离子稳定 · 氨分子释放
天冬氨酸酶催化三帧状态图
展示天冬氨酸酶活性中心在底物结合、质子提取形成烯二醇中间体、C-N键断裂释放氨分子三个阶段的微观过程。
天冬氨酸酶 · 三帧催化状态
① 底物结合
② 质子提取
③ C-N 断裂
Mg²⁺
COO⁻
COO⁻
H
NH₃⁺
Ser-OH
保守丝氨酸
Mg²⁺
COO⁻
COO⁻
NH₃⁺
Ser-O⁻
夺走 C3 质子
H
碳负离子
Mg²⁺
COO⁻
COO⁻
延胡索酸
NH₃ ↑
氨分子释放
Ser-OH
再生
Mg²⁺ 配位稳定
保守 Ser 夺质子
C=C 双键
NH₃ 离去
反式消除 → 延胡索酸
关键残基
:保守
丝氨酸
作为广义碱,从 C3 抽取质子形成碳负离子。
金属作用
:
Mg²⁺
同时配位两个羧基,稳定烯二醇中间体并极化 C-N 键。
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