🎮 匹配底物模拟物与靶向酶
根据酶的 S1 口袋特异性,为每种蛋白酶选择正确的底物模拟物离去基团
🔪
胰蛋白酶(Trypsin)
S1 口袋底部有 Asp189,偏好识别
阳离子
侧链(Arg/Lys)
4-胍基苯酯(OGp)
羧甲基硫酯
对硝基苯酯
🧪
V8 蛋白酶(Glu 特异性)
S1 口袋带正电荷,偏好识别
阴离子
侧链(Glu/Asp)
4-胍基苯酯(OGp)
羧甲基硫酯
对硝基苯酯
⚗️
胰凝乳蛋白酶(Chymotrypsin)
S1 口袋宽大且
疏水
,偏好识别芳香族侧链(Phe/Trp/Tyr)
4-胍基苯酯(OGp)
羧甲基硫酯
对硝基苯酯
🧬
底物模拟物通用原则
离去基团必须携带与 S1 口袋
互补
的特异性识别基团
特异性在离去基团上
特异性在酰基链上
与特异性无关
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