四大类肽酶的催化中心与特异性抑制剂
按亲核试剂与活化水方式分类

共价催化型

丝氨酸肽酶
· 催化三联体:Ser–His–Asp
· 形成共价酰基酶中间体
· 抑制剂:DFP / PMSF / 3,4-DCl
(有机磷不可逆酰化 Ser-OH)

半胱氨酸肽酶
· 活性中心:Cys–His(或 Cys–His–Asn)
· 巯基易被氧化失活
· 抑制剂:E-64 / 碘乙酸 / NEM / Hg²⁺
(E-64 为高选择性环氧化合物)

活化水型

天冬氨酸肽酶
· 催化基团:两个 Asp(活化水分子)
· 最适 pH 极酸(pH 2–4)
· 特异性抑制剂:Pepstatin A
(来自链霉菌的 statine 过渡态类似物)

金属肽酶
· 催化中心:Zn²⁺(或 Co²⁺ / Mn²⁺)
· 金属离子强极化配位水 → OH⁻ 进攻
· 抑制剂:EDTA / 1,10-菲啰啉
(螯合金属即失活;双金属共催化常见)
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