α/β-水解酶折叠的两步催化机制
环氧化物水解酶(EchA)活性中心的烷基化与水解
环氧化物水解酶两步催化机制 左侧展示两个酪氨酸残基活化环氧化物并由 Asp107 亲核攻击形成共价中间体;右侧展示 His275-Asp246 电荷中继系统活化水分子,水解共价中间体释放二醇。 Agrobacterium radiobacter AD1 · EchA 反应机制 (a) 烷基化反应 环氧化物 O Tyr152 —OH Tyr215 —OH H-键 H-键 Asp107 亲核体 亲核攻击 Phe108 (空间支撑) 共价酯中间体 Asp107–O–底物 进入 第二步 (b) 共价中间体水解 共价中间体 Asp107–O–底物 His275 广义碱 Asp246 电荷中继 H₂O 活化水 夺 H⁺ OH⁻ 攻击 手性邻二醇 + 再生 Asp107 Tyr152/Tyr215 活化 · Asp107 亲核 · His275-Asp246 电荷中继
α/β-水解酶折叠 — 中心 β-折叠被 α-螺旋包围,几乎所有已知细菌环氧化物水解酶共享此拓扑。
两步机制 — 第一步形成共价酯中间体(烷基化),第二步水解释放二醇并再生酶。
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